Ninja Express ini merupakan afiliasi dari Ninja Van yang ada di Singapura. Ninja Van sendiri merupakan perusahaan jasa pengiriman barang yang didirikan pada tahun 2014 di Singapura oleh tiga orang yaitu Chang Wen sebagai CEO dan Co-Founder, Shaun Chong sebagai Chief Technology Officer, dan Tan Boxian sebagai Chief Operating Officer.